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一文教会您系列之基因组共线性分析Ma [复制链接]

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大家还记得上次分享的:《科研干货

BRIG绘制原核生物比较基因组圈图》文章么?文章发布后小编收到了很多老师的咨询,希望我们再来篇基因组共线性分析软件的文章。

不怕小编没存货,就怕不知道老师们想要什么。

今天就给各位老师介绍一款强大的共线性分析软件:Mauve[1]。Mauve可用于构建多个小型基因组的比对,可以解释进化关系,也能够快速有效分析基因组之间有无大片段序列重排现象,及基因组间共线性是否良好,以及是否存在局部共线区(LocallyCollinearBlocks,LCBs),这些分析都为比较基因组学的研究和全基因组进化动力学的研究提供了基础。

先甩上

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